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北医三院梁晓龙团队NBT：工程菌捏续运输NO重塑肿瘤微环境，克服免疫疗养耐药
Nature Biotechnology——[41.7]
① 配景与瞎想：针对免疫扼制性微环境轨则免疫查验点阻断疗效的窘境，通过重塑精氨酸合成通路构建可捏续原位开释一氧化氮（NO）的工程化大肠杆菌Nissle 1917（ECN-NO）。② 中枢发现与意旨：ECN-NO通过捏久的NO开释勾引肿瘤血管正常化并重塑免疫微环境，与抗PD-L1疗法协同，在多种实体瘤模子中驱动了皆备、捏久的肿瘤消退并开发免疫回想，为克服免疫疗养耐药提供了微生物代谢搅扰新范式。③ 工程菌功能与定植：通过删除argR并抒发反馈扼制不敏锐的argAfbr、精氨酸再生酶及BsNOS，ECN-NO达成了捏续NO生成，并特异性定植于多种小鼠肿瘤组织。④ 驱动血管正常化：ECN-NO疗养权贵增强了血管周细胞笼罩，减少了血管渗漏，并改善了肿瘤注目和缺氧，其勾引的血管正常化窗口期捏久。⑤ 重编程免疫微环境：ECN-NO上调血管内皮粘附分子，促进树突状细胞和CD8+ T细胞浸润，同期贬抑T细胞耗竭象征物抒发并增多回想T细胞比例。⑥ 协同疗效与免疫回想：在MC38、CT26等多个肿瘤模子中，ECN-NO与αPD-L1勾通疗养勾引了CD8+ T细胞依赖性的肿瘤消退，并使调理小鼠大要违反高剂量肿瘤细胞的再挑战。
【原文信息】
Sustained nitric oxide production by engineered E. coli remodels the tumor microenvironment and potentiates immunotherapy
2026-03-18 ， doi: 10.1038/s41587-026-03054-y
Nature子刊：断奶期菌群若何为肠说念干细胞刻录毕生"免疫回想"？
Nature Microbiology——[19.4]
① 配景与瞎想：针对断奶期肠说念菌群塑造毕生粘膜免疫的机制，结合无菌小鼠模子、全基因组DNA甲基化测序与类器官培养，系统贯通了肠说念干细胞的表不雅遗传重编程。② 中枢发现与意旨：断奶期菌群驱动的IFNγ信号通过STAT3-TET3轴介导肠说念干细胞MHC-II基因增强子低甲基化，开发捏久表不雅遗列传念，决定了毕生粘膜免疫稳态。③ 表不雅遗传特征：正常小鼠结肠干细胞中约半数的各别甲基化区域位于增强子，且奉陪Cd74等MHC-II基因权贵低甲基化及抒发上调。④ 要津时分窗口：断奶后是菌群勾引重编程的要津期，该阶段顷刻产生的IFNγ驱动了增强子去甲基化，阻断该信号则放手此表不雅遗列传念。⑤ 菌群与疾病易理性：早期低剂量青霉素搅扰经受性吊销革兰氏阳性菌，导致CD4+ T细胞IFNγ产生权贵减少，抵制表不雅遗传调控并权贵加重结肠炎及肿瘤发生。⑥ 转录回想机制：IFNγ通过招募STAT3和TET3至Cd74增强子驱动快速去甲基化，预不休的类器官在再次受激时线路出更强且更快的转录响应。
【原文信息】
Weaning drives microbiome-mediated epigenetic regulation to shape immune memory in mice
2026-03-19 ， doi: 10.1038/s41564-026-02295-6
复旦中山病院周俭团队：肠-肺轴新疗法，益生菌外膜囊泡而已改善急性肺损害
Journal of Nanobiotechnology——[12.6]
① 配景与瞎想：为探索肠-肺轴靶向疗养急性肺损害（ALI）的新计谋，本征询索要了益生菌戈氏副拟杆菌开端的外膜囊泡（Pg-OMVs），并在博来霉素勾引的ALI小鼠模子中评估其疗效与机制。② 中枢发现与意旨：Pg-OMVs通过重塑肠说念菌群、普及胆酸（CA）水平并扼制肺巨噬细胞焦一火来缓解ALI，为基于微生物囊泡的急性呼吸困顿概述征疗养提供了新念念路。③ 体内保护效应：口服Pg-OMVs权贵松开了小鼠肺组织损害、炎症细胞浸润及促炎因子IL-6和IL-1β水平，将小鼠7天糊口率从50%普及至100%。④ 扼制焦一火通路：Pg-OMVs不休扼制了肺组织NF-κB-NLRP3炎症小体通路的激活，并权贵贬抑了肺巨噬细胞中GSDMD介导的焦一火。⑤ 菌群依赖机制：Pg-OMVs改变了肠说念菌群，增多了嗜黏卵白阿克曼氏菌丰采并贬抑了Clostridia_bacterium丰采；粪菌移植实考阐发其保护作用依赖于肠说念菌群。⑥ CA的要津作用：Pg-OMVs普及了系统CA水平；使用胆汁酸转运卵白ASBT的扼制剂A4250阻断CA回摄取逆转了其保护作用；体外实考阐发CA告成扼制了巨噬细胞焦一火。
【原文信息】
Parabacteroides goldsteinii-derived outer membrane vesicles alleviate acute lung injury via modulation of bile acid metabolism
2026-03-18 ， doi: 10.1186/s12951-026-04288-3
山东大学姜天宇团队：工程菌化身"肿瘤药厂"，原位产药精确杀癌
PLoS Biology——[7.2]
① 配景与瞎想：为改善细菌癌症疗法，本征询工程化肿瘤靶向益生菌大肠杆菌Nissle 1917（EcN），以异源合成抗癌药物罗米地辛（FK228），并在4T1荷瘤小鼠模子中评估其疗效。② 中枢发现与意旨：工程化EcN可达成肿瘤内FK228的原位出产与寄递，在保证疗效的同期权贵贬抑系统毒性，拓展了细菌靶向给药平台。③ 通路构建与优化：通过重构FK228生物合成基因簇、优化运转子及敲除depK与araC等基因，获取多个高产菌株，最高产量达1.5 mg/L，且FK228可被迫扩散开释。④ 体内疗效考证：在荷瘤小鼠中，工程菌株能定植肿瘤并原位产生FK228，其扼制肿瘤孕育后果与告成打针FK228相称，但腹黑毒性和去世率权贵贬抑。⑤ 潜在机制：卵白质组学分析辅导，工程菌的疗养同期激励了EcN关联的炎症/免疫响应与FK228影响的翻译后修饰通路，可能协同增强抗肿瘤后果。
【原文信息】
Engineered romidepsin biosynthetic pathways in Escherichia coli Nissle 1917 improve the efficacy of bacteria-mediated cancer therapy
2026-03-17 ， doi: 10.1371/journal.pbio.3003657
浙大袁长征/陈辉等：坚捏MIND饮食十余年，大脑软弱减速1~2.5岁
Journal of Neurology， Neurosurgery and Psychiatry——[7.5]
① 配景与瞎想：针对MIND饮食与遥远脑结构变化关联不解的问题，基于弗雷明汉腹黑征询后代部队1647名中老年东说念主的前瞻性数据，行使线性夹杂模子评估了遥远饮食死守性与纵向脑磁共振成像绸缪的关联。② 中枢发现与意旨：高MIND饮食死守性权贵奉陪更慢的脑结构萎缩程度，辅导该饮食模式具有减速年齿关联脑软弱的遥远神经保护后劲。③ 灰质体积关联：纵向影像学分析炫耀，MIND饮食评分每增多3分与总灰质体历年下落速率权贵减缓关联，相称于对消了20.1%的年齿关联变化或减速2.5年脑软弱。④ 脑室体积关联：更高的饮食评分权贵奉陪侧脑室迥殊是左侧侧脑室体积扩大的减缓，分别对消了8.0%和8.8%的年齿关联彭胀，相称于减速约1.0年的脑软弱。⑤ 组分与亚组特征：饮食组分分析辅导浆果和禽肉摄入与成心的脑结构变化权贵关联，且上述脑保护关联在年父老、膂力活动活跃及体重指数正常的个体中更为权贵。
【原文信息】
Adherence to the MIND diet and longitudinal brain structural changes over a decade: evidence from the Framingham heart study offspring cohort
2026-03-17 ， doi: 10.1136/jnnp-2025-336957
Nature子刊：告别回忆偏差，AI与多组学重塑饮食评估（综述）
Nature Metabolism——[20.8]
① 中枢不雅点与边界演进：饮食摄入精确测量正履历从传统主不雅敷陈向东说念主工智能、可穿着开辟及多组学工夫会通的范式转换，旨在达成分子级别的客不雅量化。② 传统评估措施局限：食品频率问卷和24小时总结法受制于回忆偏倚及夹杂膳食复杂性，常导致宏量养分素的系统性低估。③ AI与传感工夫搅扰：结总诡计机视觉、多模态大说话模子及可穿着传感器的扶助用具可达成进食事件被迫捕捉，但跨文化泛化性仍具挑战。④ 组学分子指纹跟踪：非靶向代谢组学与粪便宏基因组学提供了饮食露出的客不雅分子笔据，但受限于代谢物半衰期短及宿主代谢异质性。⑤ 宏卵白质组学芜杂：基于宏基因组信息的宏卵白质组学平台大要高精度贯通粪便中的食品源性卵白，StarSports为无创监测养分素摄入提供高分辨率技能。⑥ 微生物组代谢重塑：肠说念微生物组通过发酵生成短链脂肪酸及竞争性代谢，深化重塑养分物资的生物利费用与宿主能量获取效率。⑦ 边界挑战与明天预测：明天需将主不雅敷陈的纵进取风、AI传感的及时性与多组学的分子确证相整合，以激动个体化精确养分搅扰。
【原文信息】
Advances and opportunities in measuring dietary intake: from omics to AI
2026-03-18 ， doi: 10.1038/s42255-026-01494-z
军科院杨瑞馥/常宇骁等：从菌株到分子，一种细菌酶借力表不雅遗传促肠癌
Journal of Advanced Research——[13]
① 配景与瞎想：眇小微单胞菌（P. micra）促结直肠癌（CRC）的菌株特异性及毒力机制尚不解确，基于培养组学分离的99株临床菌株及APCMin/+小鼠模子组成了接洽其致病机制的中枢征询体系。② 中枢发现与意旨：P. micra开端的ADP核糖基挪动酶SirTM通过催化宿主组卵白H2B的表不雅遗传修饰，激活CEBPβ/SAA1/IL-17C信号轴驱动CRC进展，为阻断肠说念菌群介导的肿瘤发生提供了新靶点。③ 菌株特异性表型：体外细胞及小鼠模子实考阐发，基于促炎材干筛选出的高炎性菌株较平方菌株具备权贵更强的促CRC细胞增殖与肿瘤孕育材干。④ 要津毒力因子：相比基因组学与基因敲除本质锁定中枢毒力基因SirTM，该基因编码的SirTM卵白仅具ADP核糖基挪动酶活性而无脱乙酰酶活性。⑤ 表不雅遗传机制：质谱及CUT&Tag测序阐发，插足CRC细胞的P. micra开释SirTM并特异性催化组卵白H2B发生ADP核糖基化，导致染色质结构松散并权贵上调CEBPβ转录。⑥ 卑劣通路激活：抒发升高的CEBPβ告成促进SAA1抒发，进而以自分泌花式驱动肿瘤细胞分泌IL-17C，最终导致CRC恶化。⑦ 临床改革潜能：CRC患者粪便中SirTM转录水平权贵升高且会诊AUC达96.9%，同期敲低SAA1可权贵扼制SirTM介导的细胞增殖，辅导二者为潜在的诊疗靶点。
【原文信息】
Parvimonas micra-derived SirTM: An ADP-ribosyltransferase as a novel driver in colorectal cancer progression
2026-03-16 星空体育(StarSports)官方网站， doi: 10.1016/j.jare.2026.03.035
南开王硕团队：肠癌复发新陈迹，微生物+代谢物预测风险并揭示"内鬼"
Microbiome——[12.7]
① 配景与瞎想：针对结直肠癌术后复发预测难题，对120例患者肿瘤黏膜进行16S rRNA测序与代谢组学分析，并结合机器学习与体表里模子张开考证。② 中枢发现与意旨：激荡出由5种菌属与5种代谢物组成的复发预测特征，并揭示了精氨酸代谢物驱动致病菌协同定植的微生态互作机制。③ 多组学预测模子：机器学习模子整合消化链球菌属等5个菌属及腐胺等5个代谢物，权贵区别复发景象（AUC=0.89），其滋生风险评分是无复发糊口期的孤独预测因子（HR=1.59）。④ 致病菌协同互作：复发患者黏膜中权贵富集的具核梭杆菌与厌氧消化链球菌呈正关联，两者通过RadD黏附素介导发生共集结并酿成双菌生物膜。⑤ 黏附与定植增强：细胞及小鼠模子阐发，厌氧消化链球菌权贵增强了具核梭杆菌对结直肠癌细胞的黏附材干过甚在肠说念黏膜中的定植。⑥ 代谢物调控汇集：肿瘤微环境中耗竭的精氨酸可抵制双菌共集结，而富集的精氨酸代谢居品腐胺则呈浓度依赖性地促进双菌生物膜的酿成。
【原文信息】
The interplay between Peptostreptococcus and Fusobacterium as novel signatures in colorectal cancer recurrence
2026-03-18 ， doi: 10.1186/s40168-026-02378-w
吉大一院吕国悦团队GUT：肝癌预后新视角，AI揭示肿瘤间质比倒U型风险弧线
Gut——[25.8]
① 配景与瞎想：针对肝细胞癌中肿瘤-间质比（TSR）量化难题及预后意旨矛盾的问题，整合总结性部队与癌症基因组图谱（TCGA）数据集，开发了基于东说念主工智能的多模态预后框架。② 中枢发现与意旨：揭示了TSR与预后的倒U型非线性关联，并通过将TSR编码为高维语义符号，达成了超过传统量化措施的精确风险分层。③ 非线性风险模式：轨则性立方样条分析炫耀，TSR与去世率呈权贵非线性关联，详情风险肇端阈值为0.188，风险峰值为0.268。④ 生物学表征：转录组学与免疫组化分析辅导，高风险TSR表型奉陪肿瘤增殖、间质活化及肿瘤微环境串扰关联通路的权贵富集。⑤ 自动化量化：基于病理学基础模子的分析经由达成了无标注的自动化TSR预测，其预测值与病理内行评估高度关联（R2 > 0.9）。⑥ 多模态预后模子：符号指点的多模态会通架构将全切片图像（WSI）特征、TSR及临床变量整合为高维符号，权贵普及了预后准确性（AUC > 0.80）。
【原文信息】
Token-guided multimodal prognosis in hepatocellular carcinoma: a framework steered by tumour-stroma ratio
2026-03-18 ， doi: 10.1136/gutjnl-2025-337945
改善肠炎9菌株配方脱颖而出，重塑次级胆汁酸抗炎抗纤维化
Gut Microbes——[11]
① 配景与瞎想：针对克罗恩病肠说念纤维化疗法不及的临床问题，以获批的8株益生菌配方为对照，在DSS小鼠急/慢性结肠炎模子中，评估了富含鼠李糖乳酪杆菌与副干酪乳酪杆菌的9株配方功效，并行使多组学及Gpbar1⁻/⁻小鼠接洽机制。② 总体概述：9株益生菌通过重塑菌群并促进产生GPBAR1振奋型次级胆汁酸，在慢性结肠炎中阐扬优于8株配方的抗炎和抗纤维化作用，推崇了微生物代谢物-宿主受体轴的要津机制。③ 益生菌功效各别：在慢性DSS结肠炎中，9株配方在松开疾病活动、结肠纤维化及调理IL-6+巨噬细胞等方面权贵优于8株配方。④ 微生物代谢重塑：9株益生菌富集了粪便中的次级胆汁酸，迥殊是GPBAR1振奋剂3-oxo-DCA；其菌株抒发BSH和HSDH，可在体外代谢生成此类胆汁酸。⑤ 胆汁酸告成作用：3-oxo-DCA在体外共培养中告成扼制LPS/TNF-α勾引的巨噬细胞炎症与成纤维细胞纤维化象征物抒发。⑥ GPBAR1必要性：在Gpbar1⁻/⁻小鼠中，9株益生菌的抗炎与抗纤维化益处皆备隐匿，阐发该受体是介导其保护作用的要津通路。
【原文信息】
A bile acid-GPBAR1 network supports anti-inflammatory and anti-fibrotic benefits of probiotics in colitis
2026-03-18 ， doi: 10.1080/19490976.2026.2645125
Nature Reviews：从用具升级为平台，AI重塑炎症性肠病诊疗全景（不雅点）
Nature Reviews Gastroenterology and Hepatology——[51]
① 中枢不雅点：东说念主工智能正从专业扶助用具演变为维持IBD数据驱动精确医学的基础平台，其应用相接会诊、监测、预测与个性化疗养。② 应用边界与近况：已获考证的应用聚拢于内镜、数字病理及横断面影像，旨在减少不雅察者间各别、圭表化评分并检测东说念主眼不能见特征，以评估黏膜、组织学及透壁愈合。③ 会诊与疾病活动评估：AI扶助的胶囊内镜可大幅裁汰阅顷刻分，基于影像组学的模子能普及克罗恩病会诊准确性；深度学习模子对内镜及组织学缓解的评估准确率跳跃90%。④ 预后预测与肿瘤监测：AI能整合内镜、组织学、本质室、影像、组学及患者敷陈结局等多模态数据，对疾病复发、入院、手术风险及疗养响应进行分层预测；诡计机扶助检测与会诊系统正被应用于IBD关联肿瘤的监测。⑤ 新兴前沿应用：“内镜-组织学-组学”多模态会通、基于探头式共聚焦激显豁微内镜或内镜细胞术的肠障蔽AI评估、可穿着开辟而已监测及大说话模子的临床方案维持与患者老师，是下一代AI的探索标的。⑥ 实行的中枢挑战：临床落大地临数据异质性、算法偏见、使命流整合难题、模子“黑箱”、监管旅途不解、隐秘安全、刚正性及工夫开发的环境可捏续性等多重防碍。⑦ 明天标的与途径图：达成后劲需高质料各样化数据、严颠倒部考证、前瞻性临床历练、明确的伦理与监管框架、跨学科合作以及对模子可评释性、刚正性及临床效率性的捏续热心。
【原文信息】
Artificial intelligence in inflammatory bowel disease: bridging innovation， implementation and impact
2026-03-19 ， doi: 10.1038/s41575-026-01190-z
无创超声，预判儿童急性重度结肠炎疗养成败
Gastroenterology——[25.1]
① 配景与瞎想：为探寻儿童急性重度溃疡性结肠炎早期疗养结局的客不雅预测绸缪，在一项纳入60名生物制剂初治患者的前瞻性多中心征询中，系统评估了两次肠说念超声扫描的预测价值。② 中枢发现与意旨：系列肠说念超声参数可动作早期、非侵入性用具，有用预测儿童急性重度结肠炎对一、二线药物的疗养响应及手术风险，为临床精确方案提供了客不雅影像学依据。③ 预测一线疗养失败：对静脉打针皮质类固醇无粗犷的患者，初度IUS时左下腹和左上腹的CWT及MUS权贵更高；左下腹CWT >5 mm与MUS >7.8是预测IVCS失败的可靠截断值。④ 预测二线疗养失败：第二次IUS时左下腹CWT >4.8 mm与MUS >8.7与药物疗养（包括英夫利西单抗）失败并在8周内需行结肠切除术权贵关联。⑤ 关联遥远结局：第二次IUS时左下腹CWT和MUS较低的患者，在第8周达到无类固醇临床缓解的可能性更高。
【原文信息】
Intestinal Ultrasound Scan in Acute Severe Ulcerative Colitis in children: a multicenter prospective study on behalf of the Porto IBD Working Group of ESPGHAN
2026-03-16 ， doi: 10.1053/j.gastro.2026.02.034
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